Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NOP58Q9Y2X3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NOP58Q9Y2X3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms