Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCRT1Q9BWW7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCRT1Q9BWW7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms