Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD1Q96RS6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms