Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM18Q96B42 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMEM18Q96B42 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms