Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BEST4Q8NFU0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BEST4Q8NFU0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms