Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDCD7Q8N8D1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD7Q8N8D1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms