Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYNE4Q8N205 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYNE4Q8N205 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms