Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR53Q7Z5U6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms