Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ODF4Q2M2E3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ODF4Q2M2E3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms