Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A3Q16572 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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