Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 DGA1YOR245C 1257 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 POL2YNL262W 6669 nt3.09□□□□□ -1.91
SNF8Q12483 YHR080CYHR080C 4038 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ARG2YJL071W 1725 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 AEP2YMR282C 1743 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 IOC3YFR013W 2364 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YCL076WYCL076W 744 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YOS1YER074W-A 258 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YIL025CYIL025C 375 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 MBR1YKL093W 1020 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YPR136CYPR136C 513 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 MET16YPR167C 786 nt3.08□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ROM1YGR070W 3468 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SIZ1YDR409W 2715 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ACK1YDL203C 1872 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 BMS1YPL217C 3552 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SHU2YDR078C 672 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YDR133CYDR133C 336 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 IRC6YFR043C 714 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YGL101WYGL101W 648 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RPL13BYMR142C 600 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PEX11YOL147C 711 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YOR238WYOR238W 912 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PCI8YIL071C 1335 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TFB2YPL122C 1542 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PTM1YKL039W 1572 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 HAP4YKL109W 1665 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ALG8YOR067C 1734 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 AEP3YPL005W 1821 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TRE2YOR256C 2430 nt3.07□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 LRG1YDL240W 3054 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YDR161WYDR161W 1164 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PEX10YDR265W 1014 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 BSC2YDR275W 708 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TLG1YDR468C 675 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 LIF1YGL090W 1266 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PET54YGR222W 882 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 IRC18YJL037W 675 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ATP25YMR098C 1839 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TRI1YMR233W 681 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 OCA2YNL056W 594 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 CYC2YOR037W 1101 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 CMD1YBR109C 444 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SSE2YBR169C 2082 nt3.06□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 GLC3YEL011W 2115 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 CTM1YHR109W 1758 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YKR015CYKR015C 1707 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 MAK21YDR060W 3078 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RPS29BYDL061C 171 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 CLB3YDL155W 1284 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 LST7YGR057C 729 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 DOG2YHR043C 741 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SDS3YIL084C 984 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PCD1YLR151C 1023 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 PBA1YLR199C 831 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RLP7YNL002C 969 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RHO5YNL180C 996 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YOR082CYOR082C 342 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SPS4YOR313C 1017 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 HSH49YOR319W 642 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 NIP7YPL211W 546 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 AKR1YDR264C 2295 nt3.05□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SEC59YMR013C 1560 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 DOA4YDR069C 2781 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 ABD1YBR236C 1311 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TGL3YMR313C 1929 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 OPI6YDL096C 327 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 DET1YDR051C 1005 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RRP8YDR083W 1179 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 DUO1YGL061C 744 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 KXD1YGL079W 657 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 TAM41YGR046W 1158 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 MED11YMR112C 396 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 MRPL37YBR268W 318 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 NOP4YPL043W 2058 nt3.04□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YPL109CYPL109C 1974 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SIN4YNL236W 2925 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 DNM1YLL001W 2274 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RPL17AYKL180W 555 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YAL069WYAL069W 315 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 GTT2YLL060C 702 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RAD10YML095C 633 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SPC24YMR117C 642 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YBL094CYBL094C 333 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 HRT1YOL133W 366 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 RFM1YOR279C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 YPS6YIR039C 1614 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 SEC15YGL233W 2733 nt3.03□□□□□ -1.92
SNF8Q12483 BCS1YDR375C 1371 nt3.02□□□□□ -1.93
SNF8Q12483 YMR317WYMR317W 3423 nt3.02□□□□□ -1.93
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