Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC63Q05C16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms