Protein–RNA interactions for Protein: P53277

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF2P53277 DOG2YHR043C 741 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YNL013CYNL013C 378 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 SPS4YOR313C 1017 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RPA43YOR340C 981 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 NOP4YPL043W 2058 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YTA7YGR270W 4140 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YSP2YDR326C 4317 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TGL3YMR313C 1929 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 APN2YBL019W 1563 nt2.95□□□□□ -1.94
SYF2P53277 AGA1YNR044W 2178 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TVP18YMR071C 504 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RRG9YNL213C 645 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RPS7AYOR096W 573 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TMA16YOR252W 537 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 HPA2YPR193C 471 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RSF2YJR127C 4143 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 STP1YDR463W 1560 nt2.94□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YPS6YIR039C 1614 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YHR202WYHR202W 1809 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TPD3YAL016W 1908 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 SKN7YHR206W 1869 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TDA1YMR291W 1761 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YIG1YPL201C 1386 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 DET1YDR051C 1005 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 PDS1YDR113C 1122 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 STE14YDR410C 720 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 PAN5YHR063C 1140 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TAF14YPL129W 735 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 USV1YPL230W 1176 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 KTR6YPL053C 1341 nt2.93□□□□□ -1.94
SYF2P53277 MEK1YOR351C 1494 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YCR007CYCR007C 720 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 MRPL6YHR147C 645 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 OMA1YKR087C 1038 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RAD10YML095C 633 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YOR238WYOR238W 912 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 CMD1YBR109C 444 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 BMT2YBR141C 1014 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YBR242WYBR242W 717 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 MIG1YGL035C 1515 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 CCM1YGR150C 2595 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 CLB5YPR120C 1308 nt2.92□□□□□ -1.94
SYF2P53277 CTK1YKL139W 1587 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 GYP6YJL044C 1377 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YMR317WYMR317W 3423 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 LRG1YDL240W 3054 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YDR149CYDR149C 708 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 FRQ1YDR373W 573 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YGL082WYGL082W 1146 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 RPN1YHR027C 2982 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 AGE2YIL044C 897 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 MRPL49YJL096W 486 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TFA2YKR062W 987 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 MRPL37YBR268W 318 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 POL2YNL262W 6669 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 FUN30YAL019W 3396 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 TRE2YOR256C 2430 nt2.91□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YGR237CYGR237C 2358 nt2.9□□□□□ -1.94
SYF2P53277 DOA4YDR069C 2781 nt2.9□□□□□ -1.94
SYF2P53277 CDC40YDR364C 1368 nt2.9□□□□□ -1.94
SYF2P53277 YAK1YJL141C 2424 nt2.9□□□□□ -1.94
SYF2P53277 DRS2YAL026C 4068 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YDL026WYDL026W 312 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 DTD1YDL219W 453 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YGR149WYGR149W 1299 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YIL175WYIL175W 318 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 PET130YJL023C 1044 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 PHD1YKL043W 1101 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 RPC34YNR003C 954 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YOR314WYOR314W 330 nt2.9□□□□□ -1.95
SYF2P53277 AKR1YDR264C 2295 nt2.89□□□□□ -1.95
SYF2P53277 MSS2YDL107W 1056 nt2.89□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.89□□□□□ -1.95
SYF2P53277 BET1YIL004C 429 nt2.89□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt2.89□□□□□ -1.95
SYF2P53277 SET1YHR119W 3243 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 VPS33YLR396C 2076 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 XRN1YGL173C 4587 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 MAL12YGR292W 1755 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 MAL32YBR299W 1755 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YDR089WYDR089W 2610 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 LIF1YGL090W 1266 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 ADH4YGL256W 1149 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 SCM4YGR049W 564 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 PEX21YGR239C 867 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YPT35YHR105W 645 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YIR014WYIR014W 729 nt2.88□□□□□ -1.95
SYF2P53277 YJR111CYJR111C 852 nt2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.1 ms