Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YHR202WYHR202W 1809 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 EBS1YDR206W 2655 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CET1YPL228W 1650 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 ARG2YJL071W 1725 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MAL12YGR292W 1755 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 ETP1YHL010C 1758 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MAL32YBR299W 1755 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 NHP10YDL002C 612 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CLB3YDL155W 1284 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CWC2YDL209C 1020 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YDR431WYDR431W 312 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CFD1YIL003W 882 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 GCD14YJL125C 1152 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MRPL20YKR085C 588 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YLR042CYLR042C 486 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 AAH1YNL141W 1044 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RAS1YOR101W 930 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 DGA1YOR245C 1257 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 SPT10YJL127C 1923 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RPN6YDL097C 1305 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 ECM18YDR125C 1362 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YOR022CYOR022C 2148 nt3.61□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YGL140CYGL140C 3660 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RPN2YIL075C 2838 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MGT1YDL200C 567 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CGR1YGL029W 363 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 FIP1YJR093C 984 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 GMH1YKR030W 822 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 IDP2YLR174W 1239 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 PSY3YLR376C 729 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 NIS1YNL078W 1224 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 EAF7YNL136W 1278 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 PEX11YOL147C 711 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 DER1YBR201W 636 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MRPL27YBR282W 441 nt3.6□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RRN6YBL014C 2685 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RSF2YJR127C 4143 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 KRI1YNL308C 1776 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YDL071CYDL071C 375 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 SPT2YER161C 1002 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 EPT1YHR123W 1176 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 AHP1YLR109W 531 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 POP8YBL018C 402 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 OCA2YNL056W 594 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 ATG5YPL149W 885 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 LDH1YBR204C 1128 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 STE24YJR117W 1362 nt3.59□□□□□ -1.83
SEC28P40509 OSH3YHR073W 2991 nt3.59□□□□□ -1.84
SEC28P40509 KAR5YMR065W 1515 nt3.59□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RIT1YMR283C 1542 nt3.59□□□□□ -1.84
SEC28P40509 FAS1YKL182W 6156 nt3.59□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SET1YHR119W 3243 nt3.59□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ATP25YMR098C 1839 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 MON1YGL124C 1935 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ELM1YKL048C 1923 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 STU1YBL034C 4542 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 HCA4YJL033W 2313 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 DET1YDR051C 1005 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YDR271CYDR271C 372 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YDR336WYDR336W 945 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 PMI40YER003C 1290 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YGR190CYGR190C 366 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 DOG1YHR044C 741 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SIC1YLR079W 855 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YPT7YML001W 627 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 FDH2YPL275W 711 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RNT1YMR239C 1416 nt3.58□□□□□ -1.84
SEC28P40509 HUL5YGL141W 2733 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 CPR1YDR155C 489 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 STE14YDR410C 720 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 OTU1YFL044C 906 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 MSM1YGR171C 1728 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 CAP2YIL034C 864 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YJR061WYJR061W 2808 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 EMC2YJR088C 879 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YKT6YKL196C 603 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YLR416CYLR416C 399 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RIM11YMR139W 1113 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 MOH1YBL049W 417 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SYC1YOR179C 567 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RRP36YOR287C 903 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RDS2YPL133C 1341 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YBR089WYBR089W 600 nt3.57□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SQS1YNL224C 2304 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 PIN4YBL051C 2007 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 SPA2YLL021W 4401 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 GPP2YER062C 753 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 VFA1YER128W 612 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 TRM112YNR046W 408 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 YBR137WYBR137W 540 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 ARA1YBR149W 1035 nt3.56□□□□□ -1.84
SEC28P40509 NSP1YJL041W 2472 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 AAD3YCR107W 1092 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 TSC13YDL015C 933 nt3.55□□□□□ -1.84
SEC28P40509 LIF1YGL090W 1266 nt3.55□□□□□ -1.84
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