Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf47O95873 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C6orf47O95873 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms