Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40AO75400 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF40AO75400 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms