Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAD1O00515 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LAD1O00515 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAD1O00515 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAD1O00515 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAD1O00515 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAD1O00515 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAD1O00515 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAD1O00515 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms