Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QLW9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QLW9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
J3QLW9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
J3QLW9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QLW9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QLW9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QLW9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QLW9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QLW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QLW9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms