Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF3BA8MYP8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3BA8MYP8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms