Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCOR1Q9UKL0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms