Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VPREB3Q9UKI3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VPREB3Q9UKI3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms