Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVK-6Q9BXR3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVK-6Q9BXR3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms