Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BBS2Q9BXC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms