Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN2Q99700 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN2Q99700 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms