Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NXNL1Q96CM4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NXNL1Q96CM4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.7 ms