Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP30Q70CQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP30Q70CQ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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