Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TIMM23BQ5SRD1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TIMM23BQ5SRD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms