Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
EEA1Q15075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
EEA1Q15075 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
EEA1Q15075 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
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