Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SREBF2Q12772 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF2Q12772 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
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