Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRRC63Q05C16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC63Q05C16 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms