Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC24CP53992 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC24CP53992 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms