Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC00271P0C7V0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LINC00271P0C7V0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms