Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CSF2P04141 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CSF2P04141 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CSF2P04141 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CSF2P04141 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CSF2P04141 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms