Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNCRIPO60506 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCRIPO60506 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms