Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS9D1Q9Y2B5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS9D1Q9Y2B5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms