Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RABGEF1Q9UJ41 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RABGEF1Q9UJ41 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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