Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC17A6Q9P2U8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A6Q9P2U8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms