Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SHARPINQ9H0F6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SHARPINQ9H0F6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.7 ms