Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PACSIN1Q9BY11 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PACSIN1Q9BY11 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PACSIN1Q9BY11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms