Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPRD1AQ96P16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPRD1AQ96P16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPRD1AQ96P16 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms