Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTD1Q8N815 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTD1Q8N815 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms