Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC62Q6P9F0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms