Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSBN1Q5VWQ0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms