Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD20A3Q5VUR7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms