Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ME3Q16798 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ME3Q16798 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME3Q16798 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME3Q16798 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME3Q16798 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ME3Q16798 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ME3Q16798 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ME3Q16798 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ME3Q16798 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ME3Q16798 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME3Q16798 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME3Q16798 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ME3Q16798 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ME3Q16798 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ME3Q16798 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ME3Q16798 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ME3Q16798 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ME3Q16798 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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