Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NAB1Q13506 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NAB1Q13506 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms