Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNAPC2Q13487 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNAPC2Q13487 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms