Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 ZPR1YGR211W 1461 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 SWC3YAL011W 1878 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 STB5YHR178W 2232 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 HIR2YOR038C 2628 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 TGL2YDR058C 981 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 MAM1YER106W 909 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 MPC3YGR243W 441 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 YGR290WYGR290W 444 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 VPS29YHR012W 849 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 FMP33YJL161W 543 nt5.9□□□□□ -1.46
SUB2Q07478 PCI8YIL071C 1335 nt5.9□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 UBX3YDL091C 1368 nt5.9□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 ENT2YLR206W 1842 nt5.9□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 IMD2YHR216W 1572 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 MRC1YCL061C 3291 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 MNN11YJL183W 1269 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 COQ9YLR201C 783 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 GIM5YML094W 492 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 ATP11YNL315C 957 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RPS10AYOR293W 318 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YPL205CYPL205C 345 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YND1YER005W 1893 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 LTV1YKL143W 1392 nt5.89□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 ACC1YNR016C 6702 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RTC5YOR118W 1704 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 BSC1YDL037C 987 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RCR2YDR003W 633 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 PEA2YER149C 1263 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RCL1YOL010W 1104 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 ESC8YOL017W 2145 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RCN2YOR220W 798 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 TOM5YPR133W-A 153 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 MSH1YHR120W 2880 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 AEP2YMR282C 1743 nt5.88□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 GLN4YOR168W 2430 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 FAU1YER183C 636 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YGR042WYGR042W 816 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YIL024CYIL024C 570 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 DCC1YCL016C 1143 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 POF1YCL047C 777 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 ESA1YOR244W 1338 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SEC59YMR013C 1560 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 PDI1YCL043C 1569 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 AIM14YGL160W 1713 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 AVT1YJR001W 1809 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 VPS5YOR069W 2028 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 HSF1YGL073W 2502 nt5.87□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SCT1YBL011W 2280 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 VPS17YOR132W 1656 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RPN12YFR052W 825 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YPT32YGL210W 669 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SAE3YHR079C-A 276 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RHO4YKR055W 876 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 MRP21YBL090W 534 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 TSR4YOL022C 1227 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 TRF5YNL299W 1929 nt5.86□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 PUT2YHR037W 1728 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 APJ1YNL077W 1587 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 LAS21YJL062W 2493 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YMR046CYMR046C 1323 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 DPB4YDR121W 591 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YAP6YDR259C 1152 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 TIM10YHR005C-A 282 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RFU1YLR073C 603 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 GLO1YML004C 981 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SAS2YMR127C 1017 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RPS19BYNL302C 435 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YNL324WYNL324W 396 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YOR387CYOR387C 621 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SYF1YDR416W 2580 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 NTH2YBR001C 2343 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 PIG2YIL045W 1617 nt5.85□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 NNK1YKL171W 2787 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 VPS70YJR126C 2436 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 PHO13YDL236W 939 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 FCF1YDR339C 570 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RPL7AYGL076C 735 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 YOL131WYOL131W 327 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 RPL7BYPL198W 735 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 MAK3YPR051W 531 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 SEC27YGL137W 2670 nt5.84□□□□□ -1.47
SUB2Q07478 TPO2YGR138C 1845 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 SLY41YOR307C 1362 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YCR085WYCR085W 354 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 MXR1YER042W 555 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 CSI2YOL007C 1026 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YOR379CYOR379C 339 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 CSM4YPL200W 471 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 UGA3YDL170W 1587 nt5.83□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 MTL1YGR023W 1656 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 HIR1YBL008W 2523 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YJR087WYJR087W 351 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YAL065CYAL065C 387 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 ERP1YAR002C-A 660 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 YBL055CYBL055C 1257 nt5.82□□□□□ -1.48
SUB2Q07478 PPG1YNR032W 1107 nt5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms