Protein–RNA interactions for Protein: P55285

CDH6, Cadherin-6, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH6P55285 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH6P55285 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH6P55285 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH6P55285 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH6P55285 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH6P55285 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms