Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA4P22748 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CA4P22748 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA4P22748 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA4P22748 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA4P22748 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA4P22748 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA4P22748 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CA4P22748 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms